Aceste săpături, care au început în anul 1967, s-au bazat pe o teorie indrazneata care Marinatos sugerată pentru prima oară în 1939. Conform acestei teorii, eruptia vulcanului Santorini a avut loc în c. 1500 î.en, îngropându-un oraş preistoric sub tone de cenusa, in timp ce genereaza concomitent prăbuşirea a palatelor minoice din Creta.
Săpăturile au descoperit un oraş excelent conservate epoca bronzului, care a confirmat acest aspect al teoriei marinate ".
De atunci, oamenii de ştiinţă din Marea Egee preistoriei au fost preocupat cu stabilirea datei de eruptie. Vedere Marinatos "prevalat de mai mulţi ani. Cu toate acestea, săpăturile efectuate în ultimii 15 ani şi datarea de descoperirile de la Thira preistorice prin metode ştiinţifice demonstrează că erupţia a avut loc mult mai devreme, în jurul valorii de 1050 î.Hr.. Colapsul a palatelor minoice două secole mai târziu nu mai poate fi conectat la erupţia vulcanului din Thira. Cauza trebuie să fie acum căutat în altă parte.
Cea mai veche dovada de asezari umane in regiune este datează din epoca bronzului timpuriu, în mijlocul mileniul 3 î.Hr.. Artefactele găsite în Akrotiri arată că Santorini avut contact cu minoica din Creta, precum si Grecia continentala in timpul epocii bronzului mijlociu (1900 - 1 600 î.Hr.).
Oraşul din Akrotiri a fost distrus de erupţia mare. Dar se pare că acest lucru a fost precedat de eruptii mai mici, care au determinat locuitorii să plece în prealabil, luând cu ei posesiunile lor cele mai valoroase. Se poate deduce, de asemenea, aceasta din faptul că scheletele nu umane sau animale sau obiecte de valoare au fost găsite pe insulă.
După dezastru, două-trei secole a trecut înainte de insula a fost re-locuit.
Fenicienii, care au stabilit în insula în jurul anului 1300 i.Hr., numit Calliste ("cea mai frumoasa"), din cauza frumuseţii sale naturale de exceptie. în c 12 tarziu. BC, de spartani, condusi de Thiras, a ajuns pe insula si-a schimbat numele de la Calliste la Thira.
În timpurile elenistice Thira a fost baza navala de la Ptolemeu. În timpul epocii bizantine populaţia insulei diminuat. Thira a fost dat Nicolas Sanudo, ducele de Naxos, în 1335, şi la otomani în 1566.
În secolul al 18-lea, cu incursiuni pirat din regiune, dar toate încetare, Santorini a început să arate extindere semnificativă în agricultură, transport şi comerţ.
